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摘要:昆蟲分子生態(tài)學(xué)是一門交叉學(xué)科,利用現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)研究和解釋昆蟲生態(tài)學(xué)的問題。在昆蟲分子生態(tài)學(xué)研究中應(yīng)用較多的分子生物學(xué)標(biāo)記技術(shù)有:同工酶(蛋白質(zhì)電泳)方法、限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)方法、隨機(jī)擴(kuò)增DNA多態(tài)性(PAPD)方法、擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(AFLP)及微衛(wèi)星標(biāo)記方法(SSR)及單核苷酸多態(tài)性(SNP)。
關(guān)鍵詞:分子生物學(xué);技術(shù);昆蟲生態(tài)學(xué)
分子生態(tài)學(xué)是應(yīng)用分子進(jìn)化和群體遺傳學(xué)的理論、分子生物學(xué)的技術(shù)手段、系統(tǒng)發(fā)生學(xué)和數(shù)學(xué)的分析方法及其他學(xué)科的知識(shí)(如地理學(xué)、古氣候?qū)W等)去研究種群、進(jìn)化、生態(tài)、行為、分類、生物地理演化、生物保護(hù)等學(xué)科領(lǐng)域的各種問題。它主要通過大量使用分子生物學(xué)先進(jìn)的技術(shù)和方法,在分子水平上研究生態(tài)現(xiàn)象,闡明生態(tài)現(xiàn)象的分子機(jī)制。昆蟲分子生態(tài)學(xué)就是以昆蟲作為研究對(duì)象,應(yīng)用分子生態(tài)學(xué)的原理與方法研究昆蟲進(jìn)化和適應(yīng)機(jī)制的一門科學(xué)。它主要通過分子生物學(xué)的方法檢查昆蟲種群或個(gè)體的遺傳變異,分析和解釋遺傳變異的特點(diǎn)與規(guī)律,揭示遺傳變異所反應(yīng)的規(guī)律性的東西,從而進(jìn)一步闡明昆蟲之間一級(jí)昆蟲與環(huán)境之間的相互作用關(guān)系。其研究的最典型特色是運(yùn)用分子遺傳標(biāo)記來檢測(cè)研究對(duì)象的遺傳變異特征,揭示昆蟲的演化規(guī)律。在昆蟲分子生態(tài)學(xué)研究中應(yīng)用較多的分子生物學(xué)標(biāo)記技術(shù)有:同工酶(蛋白質(zhì)電泳)方法、限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)方法、隨機(jī)擴(kuò)增DNA多態(tài)性(RAPD)方法、擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(AFLP)及微衛(wèi)星標(biāo)記方法(SSR)及單核苷酸多態(tài)性(SNP)。其中,目前應(yīng)用最多,最簡便的是SSR和SNP技術(shù)。下面我們主要介紹在昆蟲生態(tài)學(xué)研究中幾種常用分子標(biāo)記方法。
1.同工酶方法的應(yīng)用
同工酶是指具有相同或相似催化功能而分子結(jié)構(gòu)不同的一類酶。自從Hunter和Markert創(chuàng)立同工酶酶譜技術(shù)后,同工酶譜的變化即可作為鑒定物種、研究分類與進(jìn)化、遺傳與變異的重要指標(biāo)。在昆蟲分子生態(tài)學(xué)發(fā)展之初,同工酶被廣泛應(yīng)用與昆蟲的分類、種群間抗性的遺傳變異等方面,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的廣泛應(yīng)用,同工酶技術(shù)已慢慢被淘汰。
2.RFLP技術(shù)的應(yīng)用
RFLP又叫作RestrictionFragmentLengthPolymorphism.即我們所說的限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性,而且他作為第一代的生物分子類標(biāo)記技術(shù),這種技術(shù)是指通過已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的限制性內(nèi)切酶來處理不同生物個(gè)體的DNA,通過利用限制性內(nèi)切酶的多種特異性來達(dá)到獲得不同的DN段的目的,這種技術(shù)一般是被應(yīng)用于分子雜交,放射性同位素的顯微技術(shù)中,而且也只是主要用于研究生物遺傳的研究中,自問世以來已廣泛運(yùn)用于多門生物學(xué)科研究中。在昆蟲生態(tài)學(xué)研究中可以用于昆蟲遺傳譜圖的分析、遺傳連鎖圖的構(gòu)建及數(shù)量遺傳性狀等方面的研究。
3.RAPD技術(shù)的應(yīng)用
RAPD,俗名是隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA技術(shù),它是由兩位美國科學(xué)家Wiliams和Welsh在1990年提出的,而且他們并不是研究的合作者,而是分開研究的,這種技術(shù)又被稱作任意引物PCR。對(duì)于RAPD來說,它所使用的物質(zhì)是十分不相同的,但是對(duì)于現(xiàn)存的所有引發(fā)物來說,他對(duì)于在DNA序列堿基序列上的特定結(jié)合位點(diǎn)來說,一旦這些特異性DNA位點(diǎn)達(dá)到了基因組分布的擴(kuò)增條件,他就會(huì)根據(jù)DNA堿基對(duì)的配位原則,完成DNA另一條鏈的合成。
4.AFLP技術(shù)的應(yīng)用
植物基因組的AFLP中的酶切,連接和pcr問題,只要酶切出來能看到些許彌散,pcr就應(yīng)該能看出結(jié)果才對(duì),AFLP技術(shù)的關(guān)鍵就是把握體系的問題,每一個(gè)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該有自己的一套體系,照著做一般沒有問題,分子標(biāo)記,就是純體力勞動(dòng),做得很多一般就會(huì)有結(jié)果的,這是量變到質(zhì)變的過程。做AFLP需要用到試劑盒,但試劑盒不如自己做省事,也沒必要。除非你做的量少。但是分子標(biāo)記要的就是大量重復(fù)性的勞動(dòng)。因此,試劑盒不如自己做省事,也沒必要,并且試劑盒中很重要的酶往往量不夠用,比如T4連接酶和內(nèi)切酶EcoRI,除非你做的量很少,且不需要摸索體系。酶切出來能看到些許彌散,pcr就應(yīng)該能看出結(jié)果,也不一定。接頭制作和連接體系也很重要,連接時(shí)間一般影響不是很大。
5.微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)在昆蟲生態(tài)學(xué)研究中的應(yīng)用
微衛(wèi)星標(biāo)記ms是一類由幾個(gè)(多為1-5個(gè))堿基組成的基序串聯(lián)重復(fù)而成的DNA序列,其長度一般較短,廣泛分布于基因組的不同位置,如(CA)n、(AT)n、(GGC)n等重復(fù)。自1981年Spritz首先在珠蛋白中發(fā)現(xiàn)微衛(wèi)星序列到今天微衛(wèi)星序列在生物學(xué)中的廣泛應(yīng)用,微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)走過了近30多年的發(fā)展變化。其中,20世紀(jì)80、90年代是微衛(wèi)星技術(shù)從開始到逐漸成熟的關(guān)鍵階段。1982年Hamada等在研究真核生物基因組中Z-DNA形成時(shí)發(fā)現(xiàn)了一種新的重復(fù)因素——選擇性的嘌呤-嘧啶聚合物。Jeffreys等通過對(duì)小衛(wèi)星(minisatellite)的DNA指紋圖譜鑒定證明了串聯(lián)重復(fù)的DNA具有很高的長度差異性。與此同時(shí),Tautz等的研究表明,這種“神秘而簡單冶的DNA序列是遺傳變異的重要來源。1989年Tautz首次應(yīng)用了基于PCR的微衛(wèi)星分型技術(shù)。隨著微衛(wèi)星分子標(biāo)記的廣泛使用,科研工作者對(duì)其進(jìn)化、功能及在基因組中的分布等研究的了解迅速增加。近年來,微衛(wèi)星分子標(biāo)記也被廣泛應(yīng)用于昆蟲學(xué)研究的各個(gè)領(lǐng)域。截至2012年6月,共有16396個(gè)昆蟲上微衛(wèi)星位點(diǎn)在NCBI中記錄,其中雙翅目、鱗翅目和膜翅目昆蟲的微衛(wèi)星登錄數(shù)量最多,占75%。這些微衛(wèi)星被廣泛應(yīng)用于昆蟲遺傳作圖、種群遺傳學(xué)研究、個(gè)體親緣關(guān)系鑒定等方面。
6.SNP在昆蟲分子生態(tài)學(xué)中的應(yīng)用
SNP(SingleNucleotidePolymorphism)即單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記,又稱單核苷酸多態(tài)性,指DNA序列中單個(gè)堿基的差別,堿基對(duì)由于排列方式不同,結(jié)合不同脫氧核苷酸對(duì),這些核苷酸對(duì)構(gòu)成密碼子,密碼子則以不同的排列順序編碼蛋白質(zhì),從而形成自然界多種多樣的生命。SNP在基因組可以劃分為兩種形式:一是基因編碼區(qū)的功能性突變,主要分布在基因編碼區(qū),故又稱為cSNP,這類SNP較少,其變異率僅占周圍序列的1/5,但因其在遺傳疾病研究中具有重要意義而備受關(guān)注;二是遍布于基因組的大量堿基變異。就現(xiàn)在來說,SNP技術(shù)已經(jīng)開始廣泛用于昆蟲分子生態(tài)學(xué),包括昆蟲種間鑒定,遺傳圖譜的分析、入侵害蟲種群間親緣關(guān)系的區(qū)分等研究。生態(tài)學(xué)的發(fā)展,SNP技術(shù)的萌芽是古人生態(tài)意識(shí)的總和,在古時(shí),古人并不了解整個(gè)自然界,但是他們通過長期的打魚,農(nóng)牧以及狩獵積累了大量的樸素的生態(tài)學(xué)知識(shí),比如說農(nóng)作物的生長與季候的關(guān)系、常見的動(dòng)物有哪些習(xí)性等等,在公園前四世紀(jì)時(shí),希臘學(xué)者亞里士多德就曾經(jīng)粗略的描述了動(dòng)物有種不同的棲息地,還根據(jù)動(dòng)物生活棲息地的特點(diǎn)將其分為了水棲和路棲,根據(jù)它的食性分成肉食和草食,還有雜食動(dòng)物等等。隨著人類社會(huì)的發(fā)展,人們對(duì)于生態(tài)的認(rèn)識(shí)不再僅僅局限于以往的知識(shí)積累,人們通過自己的主動(dòng)探究從而能夠獲得有關(guān)于自然界的種種知識(shí),最后能夠形成一個(gè)全面的生態(tài)學(xué)理念極其生態(tài)學(xué)系統(tǒng)的認(rèn)知應(yīng)用。本文通過描述幾種技術(shù)在昆蟲生態(tài)系統(tǒng)的運(yùn)用從而得到現(xiàn)在科技在生態(tài)系統(tǒng)中的應(yīng)用等等相關(guān)關(guān)系,這種應(yīng)用不僅使各種技術(shù)得到提高,還對(duì)我們生態(tài)系統(tǒng)的探索起著極大的作用。
參考文獻(xiàn)
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作者:汪霖 邵筠喬 單位:鞍山出入境檢驗(yàn)檢疫局 遼寧出入境檢驗(yàn)檢疫局